תכנית הלימודים תקנה לבוגריה את מלוא הכלים והידע לעיסוק מחקרי ויישומי בתחום ניתוח ההתנהגות. לימודי ניתוח התנהגות יתפרסו על פי ארבעה סמסטרים ויתקיימו אחת לשבוע, בימי ראשון. תכנית הלימודים כוללת שלושה סוגי קורסים עיקריים:

קורסי ליבה – קורסי יסוד שמטרתם הקניית ידע בסיסי ומיומנויות בסיסיות בתחום ניתוח התנהגות יישומי. הקניית מיומנויות אלו, הנלמדות לאורך כל התואר ומוצעות באופן הדרגתי, תייצר בסיס למידה אחיד לתלמידי התכנית ותאפשר להם בהמשך לבחור קורסי בחירה בהתאם לתחומי התעניינותם.

קורסי מעטפת – קורסים שנועדו לחשוף את הסטודנטים לאוכלוסיות ולקויות שונות עימם הם צפויים להיפגש במהלך עבודתם ולהעמיק את הבסיס המתודולוגי של עבודתם.

קורסי בחירה – קורסי העשרה בנושאים שונים בתחום ניתוח ההתנהגות אשר יספקו לסטודנט נקודת מבט נוספת על התחום וכלים נוספים שיוכלו לסייע בעבודתו. מטרת קורסים אלו הינה להוות תמיכה נוספת לעבודתו של הסטודנט, אם בפן הקליני ואם בפן המחקרי.

בנוסף, כוללת התכנית ללימודי ניתוח התנהגות, סמינר מחקר לבחירת הסטודנט.