מכון "כנרת" למחקר קשרי חברה, ביטחון ושלום, מוקם כמכון למחקר וללימוד יחסי הגומלין בין החברה לבין סוגי הביטחון במדינת ישראל, בראיה רב תחומית והשוואתית.המכון יעסוק בין השאר, בהיבטים הכלכליים, החברתיים, התרבותיים, המדיניים והאסטרטגיים ובהשלכותיהם המעשיות.
מיקומה של מכללת כנרת מהווה בסיס ואבן שואבת למחקר, לימוד ודיון בנושאים גיאו-אסטרטגיים הייחודיים למרחב. מפגש הגבולות ישראל-סוריה-וירדן, מהווה כר נרחב למחקר ולדיון בנושאים מדיניים כלכליים וביטחוניים דוגמת הגבולות והסדרי השלום העתידיים. מקורות המים במרחב מהווים יעד לימודי ומחקרי ובסיס לשיתוף פעולה בין אזורי לעתיד.
המכון יהווה בסיס לפיתוח הרצאות וסדנאות בנושאי: חינוך, חברה, פריפריה, תעשייה, מים, איכות סביבה וביטחון.